bioservices

@k-dense-ai · 收录于 3 周前 · 上游提交今天

Unified Python interface to 40+ bioinformatics services. Use when querying multiple databases (UniProt, KEGG, ChEMBL, Reactome) in a single workflow with consistent API. Best for cross-database analysis, ID mapping across services. For quick single-database lookups use gget; for sequence/file manipulation use biopython.

场景跨数据库分析 id映射生物信息查询

适合你，如果需要在一次工作流中查询多个生物信息数据库

/ 下载安装

https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/bioservices ↗

/ 通过 npx 安装 校验哈希

npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

/ 通过 bash 安装

curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

/ 已经装过?验证本机副本,不用重装

npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/bioservices

安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。

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怎么用

商店整理自技能原文 · 版本 ab2f84a · 表述以原文为准

它做什么

装上后，Claude可以统一调用40多个生物信息学数据库（如UniProt、KEGG、ChEMBL等），执行跨数据库查询、ID映射、序列比对和整合分析等任务。

什么时候触发

当你需要同时查询多个生物数据库（如UniProt、KEGG、ChEMBL等），或进行跨数据库ID映射、序列比对等生物信息学分析时触发。

装好后可以这样说

会调用UniProt的search和retrieve方法。

使用UniChem进行跨数据库映射。

需设置NCBI_EMAIL环境变量。

技能原文在 GitHub 查看 →

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