deeptools
NGS analysis toolkit. BAM to bigWig conversion, QC (correlation, PCA, fingerprints), heatmaps/profiles (TSS, peaks), for ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq visualization.
适合你，如果正在分析ChIP-seq、RNA-seq或ATAC-seq数据
/ 通过 npx 安装 校验哈希
npx oh-my-skill add k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools/ 通过 bash 安装
curl -fsSL https://oh-my-skill.com/install.sh | bash -s -- k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools/ 已经装过?验证本机副本,不用重装
npx oh-my-skill verify k-dense-ai/scientific-agent-skills/deeptools安装目标可用 --agent / --scope 或 --to 明确指定;省略时只会在唯一已存在的 agent 目录上自动选择,零命中或多命中会停止并提示。content_hash 缺失或不一致均拒装。
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怎么用
商店整理自技能原文 · 版本 ab2f84a · 表述以原文为准它做什么
装上后，Claude能指导你使用deepTools处理NGS数据，包括BAM转bigWig、做质量控制（如相关性、PCA、指纹图）以及生成热图和谱图等可视化。
什么时候触发
当你提出NGS相关需求，比如“把BAM转成bigWig”、“做ChIP-seq质量控制”或“画TSS周围热图”时触发。
装好后可以这样说
会用bamCoverage生成归一化覆盖轨。
会运行流程生成相关性、指纹图等。
评论
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